未元物质的核心规则其实就三条，第一条，怪兽的基础召唤规则是低星合成高星，只要合成的星数一样，其它都无所谓。比如一个三星的你可以用一个两星和一个一星，也可以用三个一星怪兽。被合成的怪兽会作为高星怪兽的素材，在游戏里叫做法力池。
但游戏有点特别的是怪兽没有攻击力防御力血量等数值，只有一个星数，这个星数也可以算作是怪物的攻击力。玩家每个回合有两个阶段，主要阶段跟战斗阶段，主要阶段就是各种铺场上怪兽，做场子。
而战斗阶段开始之后，玩家需要每次攻击时选取一只到多只怪兽，让选取怪兽的总星数超过攻击怪兽的星数，就可以算作是攻击成功，从而将某只怪兽击杀。防守方是不能选多个怪兽一起防守的，所以进攻方优势会大一些。
那如果是星数等于对方怪兽是不是就同归于尽了呢？答案并不是，游戏不允许攻击力在等于或小于的时候进行攻击，必须大于才可以，也就是说你不能主动送怪。顺便在攻击的时候游戏的战场分为前后排，当前排有任意怪的时候无法攻击后排怪物，前排对后排有保护的作用，并且怪物在攻击过后会进入束缚状态，无法继续攻击。
第二条核心规则是游戏如何判定输赢？那就是当你的损坏堆里的牌达到十张后就算失败。这个损坏堆其实就是墓地，当你的怪兽被对方打死之后就会进去。而其它的方式，比如说弃一张牌，并不会进损坏堆，而是弃牌堆。
这点跟很多卡牌游戏是不一样的，而且损坏堆在你打完一局之后是会累计的，相当于你一共十点血，最多只能死十只怪。也是因为这个原因，当对面场上没有怪的时候，你攻击对方，相当于是攻击对方的手牌，每攻击一次对方就需要从自己的手牌挑选一张损坏掉。
第三个核心规则就是游戏的抽卡，除了每回合开始抽一张之外，每次你通过融合的方式召唤怪兽后就会抽一张牌。毕竟多合一会亏卡，系统贴心的帮你补充手牌。
因此你手里有四张一星，两张两星和一张四星，纯粹从赚卡的角度讲，直接四换一只能抽一张。但先分别合成两张两星，再合成四星则可以抽三张牌。此外，当你的怪兽被攻击损坏时也能抽一张，合成抽、被打也抽，可以说只要你亏卡都会让你抽，所以这款游戏基本上是不缺牌的。
