诸葛亮作为顶级谋略武将，凭借高额智力成长和自带战法神机妙算的强力控制效果，成为许多阵容的核心。针对诸葛亮的特性，玩家可通过特定武将、战法及阵容搭配实现有效克制。克制诸葛亮的核心思路在于规避其战法触发条件或压制其输出环境。诸葛亮的神机妙算依赖敌方发动主动战法进行反制，因此减少主动战法使用或选择被动输出型武将可削弱其作用。张飞的盛气凌敌能直接缴械敌方，限制普攻与部分战法联动，同时赵云凭借洞察免疫控制，可无视诸葛亮的干扰持续输出。高爆发物理武将如马超、许褚能在诸葛亮行动前快速削减其兵力，降低其威胁。
诸葛亮通常搭配弓兵或枪兵，而骑兵对弓兵的天然克制可显著提升胜率。选择曹操、夏侯渊等魏骑武将组成突击队，利用速度优势优先出手，能在诸葛亮触发战法前造成大量伤害。盾兵阵容同样有效，如徐晃、典韦组成的魏盾，通过高额减伤和稳定反击消耗诸葛亮的兵力。需注意避免使用依赖主动战法的队伍，如都督队或蜀智队，以免被诸葛亮反制。
挫锐弯弓饮羽等战法可降低敌方主动战法发动率，间接削弱诸葛亮的作用。八门金锁阵提供的先攻效果能让己方武将抢先输出，而暂避其锋御敌屏障等减伤战法可缓解诸葛亮的谋略伤害。若诸葛亮作为主将，优先集火击杀可快速瓦解敌方阵容。
若敌方以诸葛亮为核心搭配刘备、赵云等武将，可针对性选择控制链更稳定的队伍，如桃园队或五虎枪，利用张飞的群体缴械和关羽的强力控制限制诸葛亮发挥。利用地形和行军规则，通过夹击或包围迫使敌方分散兵力，也能降低诸葛亮的战场影响力。
